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    璀璨新星-circRNA

    qq游戏赢三张牌下载 www.rvgl.net circRNA 在不同物种中具有保守性,而且存在组织表达差异,

    可以作为竞争性内源RNA(ceRNA)结合miRNA,阻断miRNA 对靶基因的抑制作用,

    具有开发疾病新型诊断与治疗方法的巨大潜力。

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    基于环状数据库和软件鉴定,进行已知circRNA和新鉴定circRNA的区分,并给出相应的统计列表和数据库中已知circRNA的命名。

    28-1
    29

    circRNA差异表达分析

    针对是否有生物学重复,采用不同软件进行差异表达分析,通过火山图可以快速查看环状在不同样品中表达的差异性以及统计学显著性。

    circRNA来源基因统计

    在生物体内,不同的基因产物相互协调来行使生物学功能,对CircRNA来源基因的通路(Pathway)注释分析有助于进一步解读基因的功能。对CircRNA来源基因KEGG的注释结果按照KEGG中通路类型进行分类注释。

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    circRNA建库与其他RNA相比,有何不同?

    对于circRNA,有2种建库方式,一种是去线性化,这种方式只可以得到circRNA的信息,因此,如果只集中研究circRNA,可以选择此种方式;另外一种是非去线性化,通过这种方式建库,可以同时获取mRNA、lncRNA和circRNA的信息。因此,关注更多RNA以及研究RNA相互关系,可以选择此种方式。

    芯片circRNA研究与二代测序技术有什么区别?

    由于目前对circRNA的研究相对较少,注释并不全面,由于芯片只能检测已知环状,因此会缺失许多新的circRNA信息以及大量特异表达的circRNA。二代测序技术通过软件进行环状RNA鉴定,既可以鉴定已知环状RNA,也可以预测新的环状RNA。因此,对于环状RNA研究而言,二代测序获取信息更全面。

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