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  • 极品三张牌 2.0:医学小RNA测序

    精准剖析sRNA

    qq游戏赢三张牌下载 www.rvgl.net Small RNA(主要包括miRNA、piRNA、siRNA)调控靶基因表达,

    参与生长发育过程和疾病发生发展,小RNA 测序可快速鉴定出已知和未知的小RNA,

    为研究小RNA 的功能及调控机制提供有力工具。

    专业项目方案设计 深度解析数据

    从选材到后续研究内容相关信息的挖掘,整个流程严谨进行,全程跟踪。

    • 实验设计

    • RNA提取

    • 建库测序

    • 数据分析

    • 售后答疑

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    公司成立八年以来,拥有丰富的医学项目分析经验,累计完成5千多个样品的医学转录调控研究

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    Small RNA筛选

    由于Dicer酶和DCL酶的特异性,最终生成的成熟miRNA长度主要集中在20nt到24nt的范围内,动物的miRNA以22nt为主,通过软件分析鉴定出的已知miRNA和新miRNA。

    14
    lncrna-5-400400

    Small RNA碱基编辑分析

    miRNA存在转录后碱基的编辑,导致种子序列(seed sequence)改变,进而使得作用的靶基因发生改变。

    miRNA表达量总体分布

    对各样本中已知和新miRNA进行表达量的统计,miRNA表达量总体分布图可以反映样品中miRNA的整体表达模式。

    16
    17

    差异miRNA靶基因通路富集分析

    分析差异表达miRNA靶基因在某一通路上是否过出现(over-presentation)即为差异表达miRNA靶基因的Pathway富集分析。利用富集因子(Enrichment Factor)分析通路的富集程度,并利用Fisher精确检验方法计算富集显著性。

    成功案例

    研究小RNA需要提供什么样品?

    提供总RNA即可,针对小RNA测序,会有相应的片段筛选,进行片段选择之后,进行小RNA建库,建库采用针对小RNA进口试剂盒。

    miRNA是如何鉴定的?

    miRNA转录起始位点多位于基因间隔区、内含子以及编码序列的反向互补序列上,其前体具有标志性的发夹结构,成熟体的形成是由Dicer/DCL酶的剪切实现的。针对miRNA的生物特征,对于比对到参考基因组的序列,百迈客利用miRDeep2软件和小RNA数据库进行已知miRNA及新的miRNA预测。

    miRNA测序不做生物学重复可以吗?

    考虑到实验设计原则,建议做生物学重复。

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